【總RNA提取】
【出現工作臺界面】
【左側】:電動勻漿機*、臺式離心機、盛有冰的容器(不帶蓋)、玻璃平皿**、微量取液器、盛有消毒槍頭的塑料盒、EP管、1ml勻漿瓶、無菌手術刀*、無菌手術鑷*、計時器
(*鼠標箭頭放上:說明框顯示:“DEPC水處理過”,3秒鐘后消失;
**鼠標箭頭放上:說明框顯示:“所有玻璃器皿先用酸處理,沖洗干凈,高壓消毒”,3秒鐘后消失)
【右側】:待提取組織(肝臟)、DEPC水*、異丙醇、氯仿、75%冰乙醇
(*鼠標箭頭放上:一秒鐘后“實驗注意”顯示:1%焦碳酸二乙酯:去除外源性RNA酶)
【畫面中央】:工作臺:一塊象征性的平臺,有“工作臺”字樣
(鼠標箭頭放上:一秒鐘后“實驗注意”顯示:DEPC水處理過)
【畫面右下角】:垃圾桶(有骷髏頭圖形標記)
【界面按鈕設計】:實驗注意:有內容時自動顯示
實驗提示:步箭頭放上自動顯示,以后每一步均自動顯示
重新操作:返回到上一步結束
退出實驗:回到本步驟界面
退出運行:回到首頁
關閉音樂:實驗開始,背景音樂自動響起。按此鍵,即關閉音樂
【操作開始】
1、工作臺中央的盛冰的容器---容器中放有和容器口齊平的碎冰。
實驗提示:按順序選擇玻璃平皿、肝臟組織、手術刀,切碎標本。
2、切碎標本 ------ 選擇玻璃平皿放置于盛冰容器中央,拖動肝臟組織放置于玻璃平皿中(鼠標箭頭放置于肝臟上時,說明框顯示:0.1g小鼠肝臟,3秒鐘后隱去)。點擊無菌手術刀,拖動手術刀至肝臟組織上(該動作完成后,自動出現說明框:切碎肝臟組織,同時手術刀上下做切碎動作,三秒鐘后動作停止,手術刀回到原位)。
實驗提示:使用無菌鑷子,將肝臟組織放入1ml勻漿瓶內。
3、移動1ml 勻漿瓶----點擊勻漿瓶,并拖動至工作臺中央的冰盒內;點擊無菌鑷子,鼠標變為鑷子形狀,將玻璃平皿上的切碎組織夾入勻漿瓶內(該動作完成后,玻璃平皿及無菌鑷子回到工作臺界面原位)
實驗提示:點擊微量吸液器,點擊裝有槍頭的塑料盒,盒打開。微量吸液器裝上槍頭,拖動微量吸液器至Trizol處,吸取Trizol,加入EP管。
4、加入Trizol---- 1 點擊微量吸液器(說明框顯示“吸取1ml液體”,3秒鐘后隱去);2 點擊裝有消毒槍頭的塑料盒(說明框顯示“1ml槍頭”,3秒鐘后隱去),加入到微量吸液器上(槍頭為藍色);3點擊微量吸液器,拖動至Trizol處,點擊Trizol(槍頭內顯示吸取1ml紅色液體);4拖動微量吸液器至勻漿瓶處,點擊微量吸液器(出現槍頭內液體注入EP管內的畫面),液體注入后,微量吸液器回到吸液架上。
實驗提示:選擇勻漿機;拖動勻漿瓶至勻漿機;點擊勻漿機,勻漿兩次,至勻漿瓶內液體變為均一液體。
5、勻漿----
① 動畫顯示逆時針擰松電機套下端連接螺紋(不用全部擰下),插入1ml勻漿杵子后順時針擰緊(如插入較緊時可邊插邊用手往上擰)。文本框顯示“擰松電機套下端連接螺紋(不用全部擰下),插入1ml勻漿杵子后擰緊(如插入較緊時可邊插邊用手往上擰)”
② 將1ml勻漿瓶夾在試管夾上,對好中心,握住手柄上下試動,至完全對直,再把瓶子夾緊(動畫顯示紅色手柄下拉,勻漿杵子伸入勻漿瓶內,瓶子夾緊后自動恢復)
③ 點擊冰盒,拖動到勻漿瓶底部,打開冰盒蓋,使勻漿瓶底部接觸冰。(文本框顯示“加冰浴防止溫度升高使組織失活”) 冰盒 開蓋后里面的冰
④ 打開電源開關,把調速調至最小,右手把握控制手柄,
運動杵子至瓶口配合處,調節調速旋扭至所要的速度。即開始勻漿,控制手柄向下運動至瓶底部(不能太用力),再往上運動至與瓶配合處,往復運動至成紅色均一液體。
⑤ 勻漿機回到原位置,勻漿瓶仍位于冰盒中,將勻漿瓶內液體倒入1.5ml離心管內,離心管置于冰盒內,勻漿瓶自動消失。
文本框顯示:
“實驗注意:1、電動玻璃勻漿機嚴禁在勻漿杵子未放入勻漿器內時懸轉,及無放入組織、液體等空瓶研磨。
2、 如使用中由于負載過大(往往運動過快)發生卡住時,手柄應速向上運動但勻漿杵子不脫離液面。
3、 勻漿要徹底,如一次勻漿不徹底,需再進行一次”
實驗提示:點擊EP管,拖出冰盒,點擊計時器,室溫下靜置5分鐘。
實驗提示:靜置使細胞充分裂解,核蛋白中核酸與蛋白解離。
6、靜置---- 1點擊EP管,拖動EP管至冰盒外,冰盒回到原位;2點擊計時器,拖動計時器至操作臺中央;3再次點擊計時器,開始計時(音樂出現倒計時聲音,說明框顯示“室溫靜置5分鐘”,持續時間3秒鐘后隱去),說明框隱去后倒計時聲音停止,計時器退回原位置,冰盒移動至操作臺中央,EP管自動至冰盒內。
實驗提示: 點擊微量吸液器,加入槍頭,吸取0.2ml氯仿。
7、加入氯仿----點擊微量吸液器(說明框顯示“吸取0.2ml液體”,3秒鐘后隱去);2 點擊裝有消毒槍頭的塑料盒(說明框顯示“0.2ml槍頭”,3秒鐘后隱去),加入到微量吸液器上;3點擊微量吸液器,拖動至氯仿處,點擊氯仿(槍頭內顯示吸取0.2ml液體;實驗注意:必需按總體積的1/5加入);4拖動微量吸液器至EP管處,EP管蓋子打開,點擊微量吸液器(出現槍頭內液體注入EP管內的畫面),液體注入后,EP管蓋子蓋上,微量吸液器槍頭自動至垃圾桶,微量吸液器回到吸液架上。
實驗注意:氯仿的作用:1、促進有機相和水相的分離;2、去除上清中痕量的酚。
實驗提示:劇烈振蕩
8、振蕩---- 1點擊EP管(說明框內顯示:劇烈震蕩15s。EP管上下顛倒混勻振蕩,3秒鐘后停止,重新位于冰盒內)
實驗提示:靜置10分鐘
9、靜置---- 1點擊計時器,拖動計時器至操作臺中央;3再次點擊計時器,開始計時(音樂出現倒計時聲音,說明框顯示“靜置10分鐘”,持續時間5秒鐘后隱去),說明框隱去后倒計時聲音停止,計時器退回原位置。
實驗提示:點擊離心機,配平,開始離心
10、離心---- 1點擊離心機,拖動離心機至操作臺中央,離心機蓋子自動打開,其內可見已放置一配平管(說明框顯示“配平管”,持續3秒鐘后隱去);2拖動EP管至配平管對面(其余孔不能放進,放置正確后,離心機蓋子自動關閉);3提示框出現:“選擇溫度______℃”,“選擇轉速--______g”,“選擇時間______min”,實驗提示分別顯示“4℃、12000g、15min”,若提示框內填寫正確,提示框自動消失;若任何一項填寫錯誤,提示框持續存在;4點擊離心機,開始離心,畫面停頓5秒鐘后,離心機蓋子自動打開(說明框顯示“離心結束”),EP管自動出現在操作臺中央(EP管內液體分為3層:上層無色透明液體,約0.5ml,鼠標置于該液體層,說明框內顯示:“水相”,約3秒鐘后說明框隱去;中間白色不透明液體,約0.1ml,鼠標置于該液體層,說明框內顯示:“蛋白變性層”,約3秒鐘后說明框隱去;下層為紅色不透明液體,約0.6ml,鼠標置于該液體層,說明框內顯示:“有機相”,約3秒鐘后說明框隱去;),離心機蓋子蓋上,回到原位。
實驗提示:選擇新的EP管,點擊微量吸液器,裝好槍頭,轉移水相液體至新的EP管內。
11、轉移---- 1點擊操作臺左側另外一只新EP管,并拖動至操作臺中央,EP管蓋子自動打開;2點擊微量吸液器(說明框顯示“吸取水相液體”,3秒鐘后隱去);3點擊裝有消毒槍頭的塑料盒(說明框顯示“0.5ml槍頭”,3秒鐘后隱去),加入到微量吸液器上;拖動微量吸液器至原EP管旁,原EP管蓋子自動打開;4微量吸液器伸入原EP管水相液體底層(實驗注意提示:“不要碰到蛋白變性層”,),點擊微量吸液器吸取0.5ml液體,拖動微量吸液器至新EP管內,再次點擊微量吸液器,槍頭內液體注入新EP管內;5重復步驟4。6原EP管蓋子自動蓋上,自動轉移至垃圾桶內;微量吸液器槍頭自動至垃圾桶,微量吸液器回到原位置;新EP管位于操作臺中央。
實驗提示:用微量吸液器加入等體積異丙醇。
12、加入異丙醇-----1點擊微量吸液器(說明框顯示“吸取0.5ml液體”,3秒鐘后隱去);2 點擊裝有消毒槍頭的塑料盒(說明框顯示“0.5ml槍頭”,3秒鐘后隱去),加入到微量吸液器上;3點擊微量吸液器,拖動至異丙醇處,點擊異丙醇(槍頭內顯示吸取0.5ml無色透明液體;實驗注意:加入等體積異丙醇);4拖動微量吸液器至EP管處,EP管蓋子打開,點擊微量吸液器(出現槍頭內液體注入EP管內的畫面),液體注入后,EP管蓋子蓋上,微量吸液器槍頭自動至垃圾桶,微量吸液器回到原位置。
實驗注意:異丙醇的作用:沉淀RNA
實驗提示:溫和顛倒混勻
13、混勻---- 1點擊EP管(說明框內顯示:溫和顛倒混勻。3秒鐘后停止)
實驗提示:室溫靜置10分鐘
14、靜置---- 1點擊計時器,拖動計時器至操作臺中央;3再次點擊計時器,開始計時(音樂出現倒計時聲音,說明框顯示“室溫靜置10分鐘”,持續時間5秒鐘后隱去),說明框隱去后倒計時聲音停止,計時器退回原位置, EP管位于操作臺中央。
實驗提示:離心10分鐘
15、離心---- 1點擊離心機,拖動離心機至操作臺中央,離心機蓋子自動打開,其內可見已放置一配平管(說明框顯示“配平管”,持續3秒鐘后隱去);2拖動EP管至配平管對面(其余孔不能放進,放置正確后,離心機蓋子自動關閉);3提示框出現:“選擇溫度______℃”,“選擇轉速--______g”,“選擇時間______min”,實驗提示分別顯示“4℃、12000g、10min”,若提示框內填寫正確,提示框自動消失;若任何一項填寫錯誤,提示框持續存在;4點擊離心機,開始離心,畫面停頓3秒鐘后,離心機蓋子自動打開(說明框顯示“離心結束”),EP管自動出現在操作臺中央(EP管內液體為無色透明液體,EP管底部可見一小塊白色固體物質),離心機蓋子蓋上,回到原位。
實驗提示:棄去上清
16、棄上清----- 1 點擊EP管,EP管蓋子打開,同時鼠標變為戴一次性手套的手的形狀;2手抓住EP管,EP管自動緩慢傾斜,將其內液體倒入垃圾桶內(音樂出現倒水的聲音,過程持續3秒鐘);3EP管復位,內無液體,底部仍可見白色固體物質,EP管蓋子保持打開。
實驗提示:加入1ml冰乙醇
17、加入冰乙醇 ---- 1點擊微量吸液器(說明框顯示“吸取1ml液體”,3秒鐘后隱去);2 點擊裝有消毒槍頭的塑料盒(說明框顯示“1ml槍頭”,3秒鐘后隱去),加入到微量吸液器上;3點擊微量吸液器,拖動至冰乙醇處,點擊異丙醇(槍頭內顯示吸取1ml無色透明液體;說明框顯示:乙醇已預冷);4拖動微量吸液器至EP管處,EP管蓋子打開,點擊微量吸液器(出現槍頭內液體注入EP管內的畫面),液體注入后,EP管蓋子蓋上,微量吸液器槍頭自動至垃圾桶,微量吸液器回到吸液器架上。
實驗注意:冰乙醇的作用:脫水、除鹽。
實驗提示:離心
18、離心---- 1點擊離心機,拖動離心機至操作臺中央,離心機蓋子自動打開,其內可見已放置一配平管(說明框顯示“配平管”,持續3秒鐘后隱去);2拖動EP管至配平管對面(其余孔不能放進,放置正確后,離心機蓋子自動關閉);3提示框出現:“選擇溫度______℃”,“選擇轉速--______g”,“選擇時間______min”,實驗提示分別顯示“4℃、7500g、5min”,若提示框內填寫正確,提示框自動消失;若任何一項填寫錯誤,提示框持續存在;4點擊離心機,開始離心,畫面停頓3秒鐘后,離心機蓋子自動打開(說明框顯示“離心結束”),EP管自動出現在操作臺中央(EP管內液體為無色透明液體,EP管底部可見一小塊白色固體物質),離心機蓋子蓋上,回到原位。
實驗提示:棄上清
19、棄上清--- 同步驟16
實驗提示:空氣干燥5-10分鐘
20、空氣干燥---- 1 畫面停頓5s鐘,說明框顯示“空氣干燥10min”。
實驗注意:空氣干燥的作用,使乙醇揮發。
實驗提示:加入DEPC水,溶解。
21、加入DEPC水---- 1點擊微量吸液器(說明框顯示“吸取50ul液體”,3秒鐘后隱去);2 點擊裝有消毒槍頭的塑料盒(說明框顯示“0.1ml槍頭”,3秒鐘后隱去),加入到微量吸液器上;3點擊微量吸液器,拖動至DEPC水處,點擊(槍頭內顯示吸取無色透明液體;說明框顯示:1%DEPC水);4拖動微量吸液器至EP管處,EP管蓋子打開,點擊微量吸液器(出現槍頭內液體注入EP管內的畫面),液體注入后,EP管蓋子蓋上,EP管底部白色物質逐漸消失,變為無色透明液體;微量吸液器槍頭自動至垃圾桶,微量吸液器回到原位置。
實驗注意:怎么還不溶?55-60℃水浴可助溶,但時間需控制在10分鐘以內。
實驗注意:提取的總RNA置于4℃或冰浴中,立即用于下游實驗,或立即置于-80℃冰箱保存。但無論采用何種方法提取和保存的RNA,都往往會被很快降解,因而建議避免提取RNA后保存。
【對提取的總RNA進行分析】
【出現工作臺界面】
【左側】:電泳槽、電泳儀、紫外燈、電子天平(內有稱量紙一張)、微波爐、小藥勺、微量取液器、盛有消毒槍頭的塑料盒、置冰盒中EP管(2只,其中一只內含有少量無色透明液體,鼠標箭頭放上,說明框顯示:“已提取的總RNA”)、塑料薄膜、三角燒瓶、50ml量筒
【右側】:瓊脂糖(白色粉末)、加樣緩沖液(藍色)、溴乙錠*(桔紅色)
實驗注意:溴乙錠【Ethidium Bromide,EB】:是一種高度靈敏的熒光染色劑,用于觀察瓊脂糖和聚丙烯酰胺凝膠中的DNA。EB是強的變性劑,具有致癌性,操作時必須戴手套?。。?由于EP具有毒性,實驗結束后,應對含有EB的溶液進行凈化處理?。。。?!你知道什么叫凈化處理嗎
【畫面中央】:工作臺:一塊象征性的平臺,有“工作臺”字樣
【畫面右下角】:垃圾桶(有骷髏頭圖形標記)
【界面按鈕設計】:實驗注意:有內容時自動顯示
實驗提示:步箭頭放上自動顯示,以后每一步均自動顯示
重新操作:返回到上一步結束
退出實驗:回到本步驟界面
退出運行:回到首頁
關閉音樂:實驗開始,背景音樂自動響起。按此鍵,即關閉音樂
【操作開始】
實驗提示:點擊電子天平,點擊藥勺,稱取瓊脂糖0.25g。
1、 稱取瓊脂糖 ----- 1點擊電子天平,拖動至操作臺中央,電子天平拉門自動打開,可見托盤上已有濾紙一張;2點擊藥勺,并拖動至瓊脂糖處;3點擊藥勺(動畫演示藥勺挖取瓊脂糖若干),并拖動至電子天平內(動畫演示藥勺傾斜,瓊脂糖落入天平內稱量紙上),藥勺回原位,電子天平門關上,說明框顯示:“0.3g瓊脂糖”,3秒鐘后濾紙連同瓊脂糖自動位于操作臺桌面上,電子天平回到原位。
實驗提示:點擊量筒,量取1×TAE電泳緩沖液25ml。
2、 量取電泳緩沖液----- 1點擊量筒,拖動至操作臺中央;2點擊裝有電泳緩沖液的試劑瓶,試劑瓶蓋子自動打開,鼠標變為手的形狀,移動“手”,抓住試劑瓶,將其內的液體傾倒入量筒內(音樂出現倒水的聲音,說明框顯示“量取25ml液體”,3秒鐘后試劑瓶回到原位,蓋子蓋上,量筒內顯示25ml液體,鼠標變為正常形狀)。
實驗提示:點擊三角燒瓶,將瓊脂糖及量好的電泳緩沖液倒入燒瓶內,并使用微量吸液器,加入1.25ulEB(溴乙錠),于微波爐內加熱,溶解瓊脂糖。
3、 溶解瓊脂糖----- 1點擊三角燒瓶,并拖動至操作臺中央;2點擊放有瓊脂糖的濾紙,鼠標變為手的形狀,抓住瓊脂糖濾紙,將瓊脂糖倒入三角燒瓶內;3“手”抓住量筒,將量筒內液體倒入三角燒瓶(音樂出現倒水的聲音),3秒鐘后液體倒完,鼠標變回原來的形狀,量筒回到原位置,濾紙回到垃圾桶內;4點擊微波爐,并拖動至桌面中央,微波爐蓋子打開; 5點擊三角燒瓶,鼠標變為手的模樣,抓住三角燒瓶,移動至微波爐內,三角燒瓶口自動出現一蓋子,微波爐蓋子關閉; 6點擊微波爐,說明框顯示“溶解瓊脂糖”,瓊脂糖顆粒逐漸溶解,變為無色透明液體,持續約30秒鐘,微波爐蓋子打開。實驗注意:小心!不要使瓊脂糖滿溢至燒瓶外! 7點擊微波爐內的三角燒瓶,鼠標變為一只白色工作手套狀,自動拿起三角燒瓶,放置于操作臺桌面上,畫面停頓3秒鐘(說明框顯示:冷卻至大約60℃,不要冷卻時間過長,避免瓊脂糖凝固);8點擊微量吸液器,并拖動至操作臺中央,點擊微量吸液器槍頭,槍頭裝至微量吸液器上;拖動微量吸液器至溴已錠處,說明框顯示“有毒,小心操作,并出現一骷髏頭畫面”,3秒鐘后消失;9點擊微量吸液器,動畫顯示淡紅色液體吸入槍頭的畫面,說明框顯示“吸取1.25ul溴已錠”,3秒鐘后消失;10拖動微量移液器至三角燒瓶內,燒瓶蓋子自動至垃圾桶,畫面顯示液體注入到瓶內的畫面,槍頭自動到垃圾桶,微量吸液器回到移液架。
實驗提示:將加樣梳放置于膠板上,將溶解后的瓊脂糖倒入膠板內,待瓊脂糖凝膠凝固后拔出點樣梳。
實驗注意:凝膠顆粒必須完全溶解【圖示瓊脂糖完全溶解和部分溶解對實驗結果影響的圖】
4、 澆板----- 1點擊膠板,并拖動至操作臺中央;2點擊點樣梳,點樣梳自動架至膠板一端,說明框顯示“齒梳的底部離膠板平面的距離為0.5-1mm”;3點擊三角燒瓶,鼠標變為戴手套手的形狀,抓住三角瓶,三角燒瓶緩慢傾倒,液體注入膠板內,膠板內液體逐漸增加(畫面要有液體為稍粘稠的感覺),說明框內顯示“注意避免氣泡”,3秒鐘后說明框隱去,液體倒完,鼠標變為原形狀,三角燒瓶回到原位置;4膠板內的瓊脂糖膠在室溫逐漸凝固成半透明的乳白色的固體(約3秒鐘),點擊點樣梳,點樣梳回到原位,畫面顯示膠板內的瓊脂糖為乳白色半透明的固體,一端可見點樣孔。
實驗提示:點擊并拖動電泳槽至操作臺中央,將膠板小心放入電泳槽內。
5、 準備電泳槽 ----- 1點擊電泳槽,并拖動電泳槽至操作臺中央,其內可見無色透明液體(說明框顯示:1*TAE電泳緩沖液);2 點擊膠板,鼠標變為手的形狀,把膠板將其放入電泳槽內(實驗注意顯示:點樣孔一端置電泳槽的陰極)。
實驗提示:使用微量吸液器,吸取5ul總RNA,點于塑料薄膜上.
6、吸取樣品 ---- 1點擊含有RNA的EP管,并拖動至操作臺中央,EP管蓋子打開;2點擊塑料薄膜,拖動至操作臺中央;3點擊微量吸液器(說明框顯示“吸取5ul總RNA液體”,3秒鐘后隱去);4點擊裝有消毒槍頭的塑料盒(說明框顯示“10ul槍頭”,3秒鐘后隱去),加入到微量吸液器上;5拖動微量吸液器至EP管處,點擊微量吸液器(出現EP管內含有總RNA的液體吸入槍頭內的畫面);6拖動微量吸液器至塑料薄膜處,點擊微量吸液器,吸液器內液體滴入到塑料薄膜上(液體為一個小水滴狀);7EP管蓋子自動蓋上,微量吸液器槍頭自動至垃圾桶,微量吸液器回到移液架上。
實驗提示:使用微量吸液器吸取6×上樣緩沖液(Loading buffer)1ul,滴入塑料薄膜上的總RNA液滴中,反復吸取幾次,混勻,避免氣泡出。
7、吸取上樣緩沖液---- 1點擊微量吸液器(說明框顯示“吸取1ul液體”,3秒鐘后隱去);2點擊裝有消毒槍頭的塑料盒(說明框顯示“10ul槍頭”,3秒鐘后隱去),加入到微量吸液器上;3拖動微量吸液器至上樣緩沖液處(藍色),點擊微量吸液器(出現EP管內液體吸入槍頭內的畫面);4拖動微量吸液器至塑料薄膜處,點擊微量吸液器,吸液器內液體被打到塑料薄膜上的總RNA的液滴內(液體為一個小水滴狀),反復吸取液體幾次,混勻,液體變為均勻淡藍色;5微量吸液器槍頭自動至垃圾桶,微量吸液器回到原位置。
實驗提示:點擊電泳槽,將塑料薄膜上的液體加入到電泳槽上的凹槽內。
8、上樣 ---- 1點擊電泳槽,并拖動至操作臺中央(電泳槽內靠近陰極側可見一排點樣孔);2點擊裝有消毒槍頭的塑料盒(說明框顯示“10ul槍頭”,3秒鐘后隱去),槍頭加入到微量吸液器上;3拖動微量吸液器至塑料薄膜處,點擊塑料薄膜上的液體(出現塑料薄膜上液體吸入槍頭的畫面);4拖動微量吸液器至凝膠板上的點樣孔處,點擊微量吸液器(出現液體注入凝膠孔內的畫面,液體為淡藍色的液體)。
實驗提示:點擊電泳儀,連接正負極,開始電泳。
9、電泳 ----- 1點擊電泳儀,電泳儀移動至操作臺中央;2點擊電泳槽上的“陰極”顯示扭,鏈接到電泳儀的“陰極”(出現黑色導線鏈接兩端的畫面),點擊電泳槽“陽極”顯示扭,鏈接到電泳儀的“陽極”(出現紅色導線鏈接兩端的畫面);2持續點擊電泳儀上“電壓選擇”按鈕,電泳儀顯示屏上電壓從“50V”快速升高到“100v”;持續點擊電泳儀上“時間選擇”按鈕,電泳儀顯示屏上時間從“10min”快速升高到“30min”;點擊電泳儀上“開始”按鈕,說明框顯示“開始電泳”,畫面顯示電泳儀陰極不斷出現很多微小氣泡,藍色液體逐漸向陽極移動(畫面持續5秒鐘);3說明框顯示“30分鐘后”,藍色液體移動至瓊脂糖凝膠的中間。
實驗提示:點擊紫外分析儀,觀察結果。
10、觀察結果---- 1點擊紫外分析儀,紫外分析儀自動移動至操作臺中央;2點擊電泳槽,拖動瓊脂糖凝膠至紫外分析儀中的平板上。電泳儀、電泳槽回到原位;3點擊紫外分析儀,觀察結果,畫面顯示“三條帶”,說明框顯示“28s ,18s,5sRNA”。
實驗提示:準備分光光度計分析RNA純度,點擊EP管,稀釋RNA。
11、準備EP管----點擊新的EP管,并拖動至工作臺中央的冰盒內(EP管外顯示刻度0.5ml,1.0ml,鼠標置于EP管上,說明框內顯示“1.5mlEP管”,3秒鐘后隱去)。
實驗提示:加入DEPC水98ul
12、加入DEPC水98ul---- 1 點擊微量吸液器(說明框顯示“吸取98ul液體”,3秒鐘后隱去);2 點擊裝有消毒槍頭的塑料盒(說明框顯示“100ul槍頭”,3秒鐘后隱去),加入到微量吸液器上;3點擊微量吸液器,拖動DEPC水處,點擊DEPC水(槍頭內顯示吸取98ul白色液體);4拖動微量吸液器至EP管處,點擊微量吸液器(出現槍頭內液體注入EP管內的畫面),液體注入后,EP管蓋子蓋上,微量吸液器回到原位置。
實驗提示:加入RNA2ul
13、加入RNA2ul ---- 1 點擊微量吸液器(說明框顯示“吸取2ul液體”,3秒鐘后隱去);2 點擊裝有消毒槍頭的塑料盒(說明框顯示“10ul槍頭”,3秒鐘后隱去),加入到微量吸液器上;3點擊微量吸液器,拖動RNA處,點擊RNA水(槍頭內顯示吸取2ul白色液體);4拖動微量吸液器至EP管處,點擊微量吸液器(出現槍頭內液體注入EP管內的畫面),液體注入后,EP管蓋子蓋上,微量吸液器回到原位置。
實驗提示:將稀釋的RNA加入比色皿中
14、將稀釋的RNA加入比色皿中----①點擊比色皿,并拖動至工作臺中央的冰盒內,② 點擊微量吸液器(說明框顯示“吸取100ul液體”,3秒鐘后隱去);③ 點擊裝有消毒槍頭的塑料盒(說明框顯示“100ul槍頭”,3秒鐘后隱去),加入到微量吸液器上;④點擊微量吸液器,拖動稀釋的RNA處,點擊稀釋的RNA水處(槍頭內顯示吸取100ul白色液體);⑤拖動微量吸液器至EP管處,點擊微量吸液器(出現槍頭內液體注入EP管內的畫面),液體注入后,EP管蓋子蓋上,微量吸液器回到原位置。
實驗提示:點擊分光光度計,分析RNA純度
15、點擊分光光度計,分析RNA純度----1點擊分光光度計,拖動分光光度計自動移動至操作臺中央,分光光度計蓋子自動打開;2將比色皿加入分光度計內,分光光度計蓋子自動合上;3點擊“開始分析”,觀察結果,畫面顯示“A260/A280=2.0”。
實驗注意:通過電泳的結果觀察分析提取的總RNA有無降解:完整的RNA的電泳可明顯觀察到28s和18s兩條帶,并且28s大約是18s的兩倍寬。若兩條帶不明顯,則說明RNA部分降解。
RNA的純度確定:A260/A280≈2.0,如果A260/A230<2,除鹽不充分。
計算RNA的濃度:RNA原液的濃度=(A260-A230)*稀釋倍數*40(ng/ul)
【逆轉錄】
【出現工作臺界面】
【左側】:PCR儀、盛有冰的容器(不帶蓋)、微量取液器、盛有消毒槍頭的塑料盒、EP管
【右側】:總RNA、MgCl2(25mM)(無色液體,水滴狀表示)、Reverse transcription 10*Buffer(白色透明波浪狀液體)、dNTP Mixture(10mM)(A、T、G、C)、RNase Inhibitor(白色球狀液體)、Random 9 mers(單鏈RNA狀)、Reverse Transcriptase( 狀)、DEPC水(水滴狀)
【畫面中央】:工作臺:一塊象征性的平臺,有“工作臺”字樣
【界面按鈕設計】:實驗注意:有內容時自動顯示
實驗提示:步箭頭放上自動顯示,以后每一步均自動顯示
重新操作:返回到上一步結束
退出實驗:回到本步驟界面
退出運行:回到首頁
關閉音樂:實驗開始,背景音樂自動響起。按此鍵,即關閉音樂
【操作開始】
實驗提示:將2ul總RNA加入EP管,點擊PCR儀,70℃孵育10分鐘。
1、 孵育 ---- 1點擊EP管, EP管蓋子自動打開,EP管自動移動至桌面中央;2點擊微量吸液器(說明框顯示“吸取2ul液體”,3秒鐘后隱去);3點擊裝有消毒槍頭的塑料盒(說明框顯示“10ul槍頭”,3秒鐘后隱去),槍頭自動加入到微量吸液器上(槍頭為黃色);4點擊微量吸液器,拖動至總RNA處,點擊總RNA(槍頭內顯示吸取2ul無色透明液體);5拖動微量吸液器至EP管處,點擊微量吸液器(出現槍頭內液體注入EP管內的畫面),液體注入后,EP管蓋子蓋上,微量吸液器回到移液架上,槍頭自動至垃圾桶內;6點擊PCR儀,并拖動至操作臺中央,PCR儀蓋子自動打開;7拖動EP管放入PCR儀內,PCR儀蓋子自動蓋上(說明框顯示:孵育:______℃,時間:-_______分鐘;實驗提示:孵育70℃,10分鐘,若填錯,實驗不能繼續);8說明框顯示:“10分鐘后”,3秒鐘后隱去,PCR儀蓋子自動打開,EP管位于桌面上的冰盒內,PCR儀蓋子關上,PCR儀回到原位。
實驗注意:去除RNA二級結構。
實驗提示:將EP管立即拖動至盛有冰的容器內。
2、配制反應液----- 1點擊MgCl2(25mM),說明框顯示:加入______ul,實驗提示:4ul,若填錯,實驗不能繼續;填寫正確后,MgCl2(25mM)自動加入EP管內,EP管內液面上升;2點擊Reverse transcription 10*Buffer,說明框顯示:加入______ul,實驗提示:2ul,若填錯,實驗不能繼續;填寫正確后Reverse transcription 10*Buffer自動加入EP管內,EP管內液面上升;3同上依次加入dNTP Mixture(10mM) 2ul、RNase Inhibitor 0.5ul、Random 9 mers 1ul、Reverse Transcriptase 1ul、DEPC水 7.5ul;4加入完成后,EP管蓋子自動蓋上,自動混勻。
實驗注意:以上液體加入不分先后順序,均需使用微量吸液器。
實驗提示:點擊PCR儀,進行cDNA反應。
3、逆轉錄----- 1點擊PCR儀, PCR儀自動移動至操作臺中央,蓋子自動打開;2拖動EP管放入PCR儀內,PCR儀蓋子自動蓋上,冰盒回到原位(說明框顯示:30℃,_______分鐘;42℃,_______分鐘;95℃,_______分鐘;5℃,_______分鐘。實驗提示顯示:10分鐘,15分鐘,5分鐘,5分鐘)。3填寫完畢后,說明框提示:開始運行,5秒鐘后隱去,PCR儀蓋子打開,EP管位于操作臺中央,PCR儀回到原位。
實驗提示:cDNA制備完成。
各種溫度設置的作用
【RT-PCR擴增hTNF-α基因】
【出現工作臺界面】
【左側】:PCR儀、振蕩器、微量取液器、盛有消毒槍頭的塑料盒、EP管
【右側】:cDNA模板(DNA雙鏈結構樣表示)、MgCl2(25mM) (無色液體,水滴狀表示)、10*Buffer(白色透明波浪狀液體)、dNTP Mixture(10mM)(AGTC)、Taq酶( 樣,鼠標放上實驗注意:-20℃保存,切勿反復凍融)、Forward引物(白色透明水滴狀液體)、Reverse 引物(白色透明水滴狀液體)、DEPC水(無色水滴狀液體)
【畫面中央】:工作臺:一塊象征性的平臺,有“工作臺”字樣
【畫面右下角】:垃圾桶(有骷髏頭圖形標記)
【界面按鈕設計】:實驗注意:有內容時自動顯示
實驗提示:步箭頭放上自動顯示,以后每一步均自動顯示
重新操作:返回到上一步結束
退出實驗:回到本步驟界面
退出運行:回到首頁
關閉音樂:實驗開始,背景音樂自動響起。按此鍵,即關閉音樂